Protein–RNA interactions for Protein: Q99JB8

Pacsin3, Protein kinase C and casein kinase II substrate protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pacsin3Q99JB8 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Fam214a-202ENSMUST00000170846 4355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Pacsin3Q99JB8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Taf5l-202ENSMUST00000165628 2973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Itpkc-201ENSMUST00000003850 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm26674-201ENSMUST00000180770 1446 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Agap1-204ENSMUST00000190096 4078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Smad1-203ENSMUST00000109885 3775 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm16867-201ENSMUST00000179116 3084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Ddx50-201ENSMUST00000020270 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmtc4-204ENSMUST00000126867 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Zc3h14-204ENSMUST00000110105 3514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Golga5-201ENSMUST00000021609 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Dnajb2-201ENSMUST00000055223 1199 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Ubr3-202ENSMUST00000112251 8081 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Pacsin3Q99JB8 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms