Protein–RNA interactions for Protein: Q99J79

Ddb2, DNA damage-binding protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 432 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddb2Q99J79 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Edn2-201ENSMUST00000030384 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Ddb2Q99J79 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Dctn3-201ENSMUST00000030158 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC15.05■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
Ddb2Q99J79 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Ddb2Q99J79 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.9 ms