Protein–RNA interactions for Protein: Q99J72

Apobec3, DNA dC->dU-editing enzyme APOBEC-3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apobec3Q99J72 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Ino80e-203ENSMUST00000106343 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Flg-203ENSMUST00000178695 777 ntAPPRIS P5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Gm9987-201ENSMUST00000069768 567 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Snapc3-202ENSMUST00000071544 942 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Apobec3Q99J72 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm6433-201ENSMUST00000118634 875 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Map3k7cl-201ENSMUST00000026700 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm45442-201ENSMUST00000210038 411 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Nudt8-202ENSMUST00000025802 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Atp6v1b2-201ENSMUST00000006435 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Pdgfa-202ENSMUST00000076095 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Gadd45b-203ENSMUST00000220246 732 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 3110070M22Rik-201ENSMUST00000099148 1123 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Apobec3Q99J72 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.7 ms