Protein–RNA interactions for Protein: Q99J19

Smim11a, Small integral membrane protein 11A, mousemouse

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Length 55 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim11aQ99J19 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Hist2h3c2-201ENSMUST00000167403 1020 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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Smim11aQ99J19 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
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Smim11aQ99J19 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Smim11aQ99J19 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Smim11aQ99J19 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
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Smim11aQ99J19 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Smim11aQ99J19 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
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Smim11aQ99J19 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
Smim11aQ99J19 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
Smim11aQ99J19 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
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