Protein–RNA interactions for Protein: Q925E8

Sptssb, Serine palmitoyltransferase small subunit B, mousemouse

Predictions only

Length 76 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SptssbQ925E8 Fam107a-202ENSMUST00000120411 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Higd1a-201ENSMUST00000060251 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Dzip1-202ENSMUST00000047208 4476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.78□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.77□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Reck-201ENSMUST00000030198 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.84
SptssbQ925E8 Agbl5-209ENSMUST00000201225 2646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 D16Ertd472e-202ENSMUST00000114219 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tmem8b-202ENSMUST00000107865 4775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Mllt10-203ENSMUST00000114671 5063 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 9130221H12Rik-201ENSMUST00000169914 1465 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Otud7b-201ENSMUST00000035519 8043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gp5-201ENSMUST00000061190 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Vgll2-202ENSMUST00000163017 1650 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Il7-205ENSMUST00000194279 4858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Med7-203ENSMUST00000109232 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.77□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Dpysl5-203ENSMUST00000114729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tmbim1-202ENSMUST00000113796 11011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Slco3a1-201ENSMUST00000026897 4589 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Chka-201ENSMUST00000025760 2319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Hat1-202ENSMUST00000112122 1899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Fbf1-201ENSMUST00000103031 5252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Bag1-203ENSMUST00000191273 1348 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Dlg4-201ENSMUST00000018700 3204 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Sv2b-202ENSMUST00000165175 5524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.76□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Hoxa5-201ENSMUST00000048794 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Hnrnpll-201ENSMUST00000061331 3116 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Phox2b-202ENSMUST00000174251 1177 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Per1-203ENSMUST00000102605 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Fam185a-201ENSMUST00000056045 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Plekhg2-203ENSMUST00000121085 4649 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Nkain2-203ENSMUST00000191234 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Zfp444-204ENSMUST00000108567 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Myh3-202ENSMUST00000108689 6031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.75□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Kif1a-210ENSMUST00000190723 6141 ntTSL 5 BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Prss32-201ENSMUST00000061725 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
SptssbQ925E8 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.74□□□□□ -0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.2 ms