Protein–RNA interactions for Protein: Q923T7

Trim7, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM7, mousemouse

Predictions only

Length 510 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim7Q923T7 Cadps2-201ENSMUST00000018122 4723 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Ints8-201ENSMUST00000044616 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 B230217C12Rik-201ENSMUST00000054783 1189 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Trim7Q923T7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 6430548M08Rik-201ENSMUST00000034281 5564 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Mag-203ENSMUST00000187137 2434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Efr3a-201ENSMUST00000015146 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tead1-201ENSMUST00000059768 9964 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Cep152-201ENSMUST00000089776 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm15908-201ENSMUST00000154345 1091 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Trim7Q923T7 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms