Protein–RNA interactions for Protein: Q922Y2

Trim59, Tripartite motif-containing protein 59, mousemouse

Predictions only

Length 403 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim59Q922Y2 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Casp3-201ENSMUST00000093517 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Napa-201ENSMUST00000006181 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Fgfr1op2-202ENSMUST00000058245 918 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Usb1-201ENSMUST00000034245 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Pacsin1-202ENSMUST00000097360 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Snip1-201ENSMUST00000052183 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ttyh1-217ENSMUST00000206869 1491 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Celf3-208ENSMUST00000198316 2505 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 AU022751-202ENSMUST00000117544 2201 ntAPPRIS P4 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Casp3-204ENSMUST00000211115 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Gm9821-201ENSMUST00000178895 1953 ntAPPRIS P1 BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
Trim59Q922Y2 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Erich2-201ENSMUST00000100041 1749 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Traf3-203ENSMUST00000117269 6972 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Trim59Q922Y2 Mid1ip1-202ENSMUST00000115524 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms