Protein–RNA interactions for Protein: Q921F2

Tardbp, TAR DNA-binding protein 43, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 414 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TardbpQ921F2 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Exog-202ENSMUST00000164213 2627 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Gpr162-204ENSMUST00000204667 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
TardbpQ921F2 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Rnf157-202ENSMUST00000106398 4553 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm34391-201ENSMUST00000203706 907 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Slc10a4-201ENSMUST00000031127 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ece2-202ENSMUST00000122306 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tmem131-208ENSMUST00000194563 6698 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 9330171B17Rik-201ENSMUST00000035939 2073 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Rnaseh2a-202ENSMUST00000109736 2981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
TardbpQ921F2 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39 ms