Protein–RNA interactions for Protein: Q920D3

Med28, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 28, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med28Q920D3 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Smarcd1-201ENSMUST00000023759 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Hs3st5-203ENSMUST00000168572 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
Med28Q920D3 Psmg1-202ENSMUST00000117044 807 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Pqlc1-205ENSMUST00000131780 2080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ak3-201ENSMUST00000025696 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Wwc2-201ENSMUST00000057561 8678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ptch1-201ENSMUST00000021921 7725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Kmt5b-216ENSMUST00000176926 1551 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Kat2a-202ENSMUST00000103118 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Kat2a-201ENSMUST00000006973 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Kdm7a-201ENSMUST00000002305 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Parp6-201ENSMUST00000026267 2709 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Psmd8-201ENSMUST00000059642 1540 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Cacng2-201ENSMUST00000019290 5510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Timp2-201ENSMUST00000017610 3709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Zscan2-201ENSMUST00000044115 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Loxl4-205ENSMUST00000171432 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 B930094E09Rik-201ENSMUST00000164667 1240 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Cadps2-206ENSMUST00000115361 4571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ppp4r3a-202ENSMUST00000163095 4083 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Pkp2-201ENSMUST00000039408 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm45605-201ENSMUST00000210265 4269 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Cfap36-201ENSMUST00000020754 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ttll5-204ENSMUST00000110220 2655 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ddi2-201ENSMUST00000102484 9553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Myrf-202ENSMUST00000186056 3636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 C77080-201ENSMUST00000052602 5187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm7860-201ENSMUST00000121190 879 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Pcyt1a-202ENSMUST00000104893 4951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Plk1-201ENSMUST00000033154 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Adgrb2-208ENSMUST00000121049 4871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Meis2-204ENSMUST00000110906 3229 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Hnrnpl-202ENSMUST00000172529 1898 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Map4k5-202ENSMUST00000110567 4250 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Cdk16-201ENSMUST00000033380 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Tex19.2-201ENSMUST00000039146 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Fam83h-202ENSMUST00000170153 4534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Agbl5-213ENSMUST00000201917 3579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Srsf11-204ENSMUST00000121326 3106 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Med28Q920D3 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms