Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
SncbQ91ZZ3 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.02■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Vim-201ENSMUST00000028062 2193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Zhx1-201ENSMUST00000070143 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Mta1-203ENSMUST00000109723 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Mta1-204ENSMUST00000109726 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Mta1-205ENSMUST00000109727 2789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Rbck1-201ENSMUST00000028964 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Shank3-201ENSMUST00000039074 7131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Gpsm1-202ENSMUST00000066936 3384 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 C130074G19Rik-201ENSMUST00000048308 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Tlnrd1-201ENSMUST00000094216 4433 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Ckap4-201ENSMUST00000053871 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 AC153526.5-201ENSMUST00000218661 2147 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Mff-212ENSMUST00000162003 2087 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Med26-201ENSMUST00000058534 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Tal1-201ENSMUST00000030489 4213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Akt2-214ENSMUST00000167435 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Trappc10-201ENSMUST00000000384 5047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Paxbp1-202ENSMUST00000118522 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 B3galt6-201ENSMUST00000052185 3184 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Sept11-205ENSMUST00000201700 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Elavl3-201ENSMUST00000003501 5014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Tmem28-201ENSMUST00000096363 3909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Tead3-206ENSMUST00000156862 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Nlk-201ENSMUST00000142739 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Dcaf17-203ENSMUST00000112159 2490 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Samd4-204ENSMUST00000125688 1773 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
SncbQ91ZZ3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms