Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZW3

Smarca5, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily A member 5, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,051 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smarca5Q91ZW3 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Dnajb2-208ENSMUST00000188346 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Atp11a-202ENSMUST00000091237 7443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Smarca5Q91ZW3 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Smarca5Q91ZW3 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.1 ms