Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZQ1

Pde6c, Cone cGMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit alpha', mousemouse

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Length 861 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pde6cQ91ZQ1 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Trim63-202ENSMUST00000105875 1886 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Zcchc6-207ENSMUST00000225576 2499 ntBASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Pde6cQ91ZQ1 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Abl1-202ENSMUST00000075759 6327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Pde6cQ91ZQ1 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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