Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Casp8-204ENSMUST00000191201 1849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Alg3-201ENSMUST00000045918 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 1810043G02Rik-201ENSMUST00000105397 1818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Rabepk-202ENSMUST00000113086 1106 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Mrgpra9-201ENSMUST00000098436 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Stk33-203ENSMUST00000121378 1304 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12689-201ENSMUST00000094955 1359 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Slc5a4bQ91ZP4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Tedc1-201ENSMUST00000049271 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Fam53b-204ENSMUST00000106165 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Cplx3-202ENSMUST00000215487 594 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 AC154757.1-201ENSMUST00000228289 336 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Htra3-202ENSMUST00000114233 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Hagh-202ENSMUST00000118788 1191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Kcng4-202ENSMUST00000164382 1875 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Zbtb25-204ENSMUST00000176278 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Nckipsd-206ENSMUST00000195323 467 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Smdt1-201ENSMUST00000023086 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15500-202ENSMUST00000071641 1019 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 1700086L19Rik-201ENSMUST00000095617 706 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gtf2e2-201ENSMUST00000167264 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Cd40-202ENSMUST00000073707 1596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm5745-201ENSMUST00000183748 313 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Ppp1r16a-201ENSMUST00000037551 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 AB041806-201ENSMUST00000062902 2105 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Mafg-203ENSMUST00000106181 840 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Fau-202ENSMUST00000178310 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Irak1bp1-202ENSMUST00000113245 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Hmbs-201ENSMUST00000077353 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Fis1-202ENSMUST00000111094 948 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Hmgb1-208ENSMUST00000139443 923 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16156-201ENSMUST00000141168 713 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm16194-203ENSMUST00000141239 362 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem208-201ENSMUST00000015000 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37171-201ENSMUST00000192636 1185 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Dad1-201ENSMUST00000022781 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 A4galt-201ENSMUST00000049530 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Slc5a4bQ91ZP4 Ltc4s-202ENSMUST00000102772 649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms