Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Ttc1Q91Z38 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Ric1-201ENSMUST00000043610 7190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Nosip-201ENSMUST00000003513 1814 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Rbm33-204ENSMUST00000114884 6256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Ulk1-201ENSMUST00000031490 5213 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Fosl1-201ENSMUST00000025850 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Ttc1Q91Z38 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.4 ms