Protein–RNA interactions for Protein: Q91YQ3

Csdc2, Cold shock domain-containing protein C2, mousemouse

Predictions only

Length 154 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Csdc2Q91YQ3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Klk7-201ENSMUST00000032955 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.38□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Zfp668-201ENSMUST00000054415 5768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Agps-201ENSMUST00000047232 7359 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Bricd5-201ENSMUST00000054946 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Sox13-201ENSMUST00000094551 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Klhdc8b-207ENSMUST00000193286 2956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Ebf3-208ENSMUST00000210774 2994 ntTSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.37□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Tcta-201ENSMUST00000044725 1668 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Antxr1-205ENSMUST00000205033 3160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Nkx2-1-201ENSMUST00000001536 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Grifin-201ENSMUST00000042993 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Adam15-202ENSMUST00000074582 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 A930033H14Rik-201ENSMUST00000170048 2969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Scarf1-202ENSMUST00000118243 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.36□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Kat5-201ENSMUST00000113641 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Golim4-201ENSMUST00000038563 5546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Prcd-205ENSMUST00000178875 1227 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Ndufa5-201ENSMUST00000023851 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 AC131586.2-201ENSMUST00000228370 1512 ntBASIC11.35□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Anks1b-214ENSMUST00000182356 7561 ntTSL 5 BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Csdc2Q91YQ3 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.34□□□□□ -0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.4 ms