Protein–RNA interactions for Protein: Q91YJ2

Snx4, Sorting nexin-4, mousemouse

Predictions only

Length 450 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx4Q91YJ2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm26821-201ENSMUST00000181954 2652 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Celf6-204ENSMUST00000121266 2610 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Cep104-201ENSMUST00000047497 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Stx18-201ENSMUST00000031008 1471 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Snx4Q91YJ2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.5 ms