Protein–RNA interactions for Protein: Q91YI1

Atg13, Autophagy-related protein 13, mousemouse

Predictions only

Length 516 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atg13Q91YI1 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Trim58-201ENSMUST00000075084 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Mrpl10-201ENSMUST00000001485 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Fbxo30-201ENSMUST00000070300 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Agfg1-206ENSMUST00000189220 8044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Irx3-202ENSMUST00000175795 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Atg13Q91YI1 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Dus1l-202ENSMUST00000106133 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Tbc1d25-204ENSMUST00000172020 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 H2-DMb1-201ENSMUST00000114232 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ythdf3-201ENSMUST00000108345 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Eif6-202ENSMUST00000109638 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Chchd2-ps-201ENSMUST00000117487 462 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Gm12350-201ENSMUST00000121208 462 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Fahd2a-201ENSMUST00000028848 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Tagln-201ENSMUST00000034590 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Mex3d-201ENSMUST00000105350 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Gm10060-201ENSMUST00000212002 111 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ly6g6f-201ENSMUST00000038507 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Klhl36-201ENSMUST00000034287 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Olig2-201ENSMUST00000035608 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Rab3ip-201ENSMUST00000020375 2690 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Lancl2-201ENSMUST00000050077 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 AC131586.3-201ENSMUST00000228355 1367 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Kmt5b-204ENSMUST00000113970 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Dguok-202ENSMUST00000113888 1007 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Lgals3-203ENSMUST00000146468 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Dguok-201ENSMUST00000014698 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Atg13Q91YI1 Ighv1-15-201ENSMUST00000192077 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms