Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC0

Setd3, Histone-lysine N-methyltransferase setd3, mousemouse

Predictions only

Length 594 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Setd3Q91WC0 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Ccdc125-202ENSMUST00000170347 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Map4k5-210ENSMUST00000171211 4334 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Rpl39l-201ENSMUST00000044103 805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Hist1h2br-203ENSMUST00000180288 1256 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Hist1h2bq-202ENSMUST00000091749 1254 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Setd3Q91WC0 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Mtg2-202ENSMUST00000108901 1444 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Grk6-201ENSMUST00000001115 2994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Cdk12-203ENSMUST00000107539 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Setd3Q91WC0 Wipf1-201ENSMUST00000094681 4728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms