Protein–RNA interactions for Protein: Q91W92

Cdc42ep1, Cdc42 effector protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 409 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdc42ep1Q91W92 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Rpp25-201ENSMUST00000080514 1423 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Timm29-201ENSMUST00000062125 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Foxf1-201ENSMUST00000181504 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Nkd1-201ENSMUST00000034086 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Fthl17f-201ENSMUST00000097029 847 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Tbc1d2b-202ENSMUST00000128874 3473 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Wtap-205ENSMUST00000160781 2442 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Gas1-201ENSMUST00000065086 2961 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Cdc42ep1Q91W92 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Gm37722-201ENSMUST00000193757 208 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Nit1-202ENSMUST00000111295 1335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Dmap1-201ENSMUST00000102687 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Ddx39b-203ENSMUST00000173731 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Gm45844-202ENSMUST00000209325 2450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Cdc42ep1Q91W92 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61 ms