Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ8

Nprl3, GATOR complex protein NPRL3, mousemouse

Predictions only

Length 569 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nprl3Q8VIJ8 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Prr14-201ENSMUST00000033095 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Pnpt1-201ENSMUST00000020756 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Strn-203ENSMUST00000145910 8629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Fmnl2-202ENSMUST00000050719 3380 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Rab6a-202ENSMUST00000098252 3110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Gm21596-201ENSMUST00000178049 1316 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Nprl3Q8VIJ8 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Umad1-202ENSMUST00000159335 2615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Hpca-202ENSMUST00000095807 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Nprl3Q8VIJ8 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms