Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHJ7

Ppargc1b, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma coactivator 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 1,014 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppargc1bQ8VHJ7 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Synj2bp-202ENSMUST00000114201 1121 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm28707-201ENSMUST00000186134 558 ntTSL 3 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Prl8a1-201ENSMUST00000006664 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 AC107452.3-201ENSMUST00000228807 1308 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Csnk1g3-201ENSMUST00000069597 4394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Tub-201ENSMUST00000033341 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gm37939-201ENSMUST00000192309 447 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Dlgap4-205ENSMUST00000109567 4840 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Sprn-201ENSMUST00000059241 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Inpp4a-201ENSMUST00000027287 5691 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Ppargc1bQ8VHJ7 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.6 ms