Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl21-202ENSMUST00000025745 1138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 She-201ENSMUST00000050401 5733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Zfp92-202ENSMUST00000086470 2050 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rasa2-201ENSMUST00000034984 5813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Nploc4-201ENSMUST00000044271 4121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Uchl1-201ENSMUST00000031131 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Bax-201ENSMUST00000033093 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Cacna1b-204ENSMUST00000102939 9736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Hsbp1-201ENSMUST00000034300 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
Vps4aQ8VEJ9 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Bmt2-202ENSMUST00000203078 4462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Etnk1-201ENSMUST00000032413 6433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Vps4aQ8VEJ9 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms