Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE97

Srsf4, Serine/arginine-rich splicing factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf4Q8VE97 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Appl2-201ENSMUST00000020500 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tmem94-202ENSMUST00000103033 5238 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Opa3-202ENSMUST00000161711 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Adrb2-201ENSMUST00000053640 2143 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Srsf4Q8VE97 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.9 ms