Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE80

Thoc3, THO complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Thoc3Q8VE80 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Tyw5-209ENSMUST00000162686 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Eno1-202ENSMUST00000080926 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Fndc11-202ENSMUST00000108835 1154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Icam5-201ENSMUST00000019616 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Thoc3Q8VE80 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
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