Protein–RNA interactions for Protein: Q8VE18

Smg8, Protein SMG8, mousemouse

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Length 991 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smg8Q8VE18 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Ndufb8-201ENSMUST00000026222 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Alkbh2-201ENSMUST00000053657 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Psmg4-201ENSMUST00000124996 474 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 S100a16-202ENSMUST00000098911 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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Smg8Q8VE18 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Smg8Q8VE18 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
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Smg8Q8VE18 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
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Smg8Q8VE18 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Pea15a-202ENSMUST00000111247 2435 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gnptab-201ENSMUST00000020251 5390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Gm8969-201ENSMUST00000199694 526 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Smg8Q8VE18 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.8 ms