Protein–RNA interactions for Protein: Q8VCW2

Krt25, Keratin, type I cytoskeletal 25, mousemouse

Predictions only

Length 446 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt25Q8VCW2 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Slc30a5-205ENSMUST00000225922 2722 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 C2cd4c-202ENSMUST00000178228 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Krt25Q8VCW2 Xrcc6-202ENSMUST00000100399 3296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Krt25Q8VCW2 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20 ms