Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBT6

Apobr, Apolipoprotein B receptor, mousemouse

Predictions only

Length 942 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ApobrQ8VBT6 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm12644-201ENSMUST00000119935 606 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Hist1h4j-201ENSMUST00000087714 774 ntAPPRIS P1 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 H2-Q7-202ENSMUST00000076256 1523 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Fez2-201ENSMUST00000070039 1939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Sort1-201ENSMUST00000102632 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Kctd14-202ENSMUST00000121987 1210 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Enkd1-201ENSMUST00000013299 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm33054-201ENSMUST00000216588 313 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Dmtn-210ENSMUST00000228824 2377 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Fam118a-201ENSMUST00000023069 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Ift74-202ENSMUST00000107104 1713 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Mras-202ENSMUST00000119472 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
ApobrQ8VBT6 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC21.58■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Dtwd2-201ENSMUST00000025383 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 AC123834.2-201ENSMUST00000224038 2340 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
ApobrQ8VBT6 Gm15295-201ENSMUST00000139874 488 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.9 ms