Protein–RNA interactions for Protein: Q8R4Y8

Rttn, Rotatin, mousemouse

Predictions only

Length 2,226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RttnQ8R4Y8 Tollip-202ENSMUST00000055819 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Snx14-205ENSMUST00000173011 2238 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Sec14l1-203ENSMUST00000103026 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Pald1-201ENSMUST00000020289 4282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Rps6ka1-201ENSMUST00000003741 3085 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Arhgef10l-203ENSMUST00000097820 4382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Cntln-201ENSMUST00000047023 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Anks6-201ENSMUST00000084616 3552 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 4930426L09Rik-201ENSMUST00000028069 1459 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Nr1h2-202ENSMUST00000107910 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Scamp4-201ENSMUST00000079883 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Hspa5-202ENSMUST00000100171 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 Wnk1-202ENSMUST00000060043 10575 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RttnQ8R4Y8 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms