Protein–RNA interactions for Protein: Q8R3Q6

Ccdc58, Coiled-coil domain-containing protein 58, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp943-202ENSMUST00000153985 1598 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Svip-201ENSMUST00000098414 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tor3a-207ENSMUST00000188964 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Pex12-205ENSMUST00000175741 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cyp2r1-201ENSMUST00000032908 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rab20-201ENSMUST00000033900 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fam78b-206ENSMUST00000190081 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fam83f-201ENSMUST00000023044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf3-204ENSMUST00000105340 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm6583-201ENSMUST00000051117 2233 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fgf2os-201ENSMUST00000153785 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm13509-201ENSMUST00000119733 1308 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Endov-203ENSMUST00000106245 5126 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Papd4-205ENSMUST00000225868 3081 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 AC108858.1-201ENSMUST00000228461 1498 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 St7l-211ENSMUST00000200132 2636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Adora2a-201ENSMUST00000105420 2596 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Alad-202ENSMUST00000107444 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
Ccdc58Q8R3Q6 Sept8-203ENSMUST00000120878 1806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms