Protein–RNA interactions for Protein: Q8R344

Ccdc12, Coiled-coil domain-containing protein 12, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc12Q8R344 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Map2k5-201ENSMUST00000034920 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm13327-201ENSMUST00000133391 2741 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Sept8-201ENSMUST00000108987 4436 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Klhl40-201ENSMUST00000098272 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm10516-201ENSMUST00000180598 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm38285-201ENSMUST00000192928 922 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Fubp1-205ENSMUST00000196695 2374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Hif3a-201ENSMUST00000037762 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Mir155hg-202ENSMUST00000185662 1362 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Ccdc12Q8R344 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Dennd4b-202ENSMUST00000129564 5647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ripk1-201ENSMUST00000021844 3266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ptprn-201ENSMUST00000027404 3554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Fbxl3-206ENSMUST00000145693 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Htr3a-201ENSMUST00000003826 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ccdc12Q8R344 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.1 ms