Protein–RNA interactions for Protein: Q8R1B8

Rorb, Nuclear receptor ROR-beta, mousemouse

Predictions only

Length 470 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RorbQ8R1B8 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Zxdc-202ENSMUST00000075117 4126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Magi1-201ENSMUST00000055224 7007 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ppfia3-207ENSMUST00000211067 4565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Dmgdh-201ENSMUST00000048001 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ccdc59-201ENSMUST00000020049 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Isg20l2-201ENSMUST00000055984 2893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ptbp2-213ENSMUST00000200097 3777 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Pcdha9-201ENSMUST00000115659 5341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Shc1-202ENSMUST00000094378 2617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Camsap3-201ENSMUST00000057028 4450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
RorbQ8R1B8 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Nyx-201ENSMUST00000050434 5183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Rcc2-201ENSMUST00000038893 3767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Zbtb11os1-201ENSMUST00000186480 1350 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 Eif6-201ENSMUST00000029142 1500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
RorbQ8R1B8 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.3 ms