Protein–RNA interactions for Protein: Q8R0A0

Gtf2f2, General transcription factor IIF subunit 2, mousemouse

Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2f2Q8R0A0 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Hr-201ENSMUST00000022691 5487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Bhlhe41-201ENSMUST00000032386 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Zfp281-201ENSMUST00000047734 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Gprc5b-201ENSMUST00000008878 4518 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
Gtf2f2Q8R0A0 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Spata3-208ENSMUST00000149469 1110 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Trpc1-204ENSMUST00000189137 4559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Flt1-203ENSMUST00000110529 6292 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Dvl2-201ENSMUST00000019362 2968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Bicd2-201ENSMUST00000048544 6309 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
Gtf2f2Q8R0A0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms