Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4Z2

Fndc5, Fibronectin type III domain-containing protein 5, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fndc5Q8K4Z2 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Clybl-201ENSMUST00000026625 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Kif21a-204ENSMUST00000109287 6124 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Iars2-201ENSMUST00000027921 5471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Mboat4-201ENSMUST00000095345 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Hoxc4-202ENSMUST00000165375 2121 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Tcf24-202ENSMUST00000185184 4193 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Hnrnpll-205ENSMUST00000184635 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Txnl1-201ENSMUST00000025476 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ngly1-201ENSMUST00000022310 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Etnk2-203ENSMUST00000135222 2297 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Gnal-201ENSMUST00000025402 5616 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Fndc5Q8K4Z2 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms