Protein–RNA interactions for Protein: Q8K448

Abca5, ATP-binding cassette sub-family A member 5, mousemouse

Predictions only

Length 1,642 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abca5Q8K448 Tmed9-201ENSMUST00000109905 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abca5Q8K448 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abca5Q8K448 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abca5Q8K448 Gfra2-202ENSMUST00000227633 1480 ntBASIC26.08■■□□□ 1.77
Abca5Q8K448 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abca5Q8K448 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.77
Abca5Q8K448 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.08■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Gm8000-201ENSMUST00000188378 592 ntBASIC26.07■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.07■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Naa10-206ENSMUST00000114391 834 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Frs3os-201ENSMUST00000136531 978 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Rfc4-201ENSMUST00000023598 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Paip2-201ENSMUST00000041314 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.06■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Grk3-203ENSMUST00000197776 1570 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Dok3-201ENSMUST00000047877 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Fam3a-206ENSMUST00000114143 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.05■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Apopt1-201ENSMUST00000040519 1065 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Chrm4-201ENSMUST00000045537 1440 ntAPPRIS P1 BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.04■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Slc16a10-202ENSMUST00000213488 2325 ntTSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Cend1-201ENSMUST00000084436 1672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Smpd5-202ENSMUST00000163991 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Map7d2-203ENSMUST00000112471 3670 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC26.03■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Dtd1-201ENSMUST00000028917 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Hist1h1c-201ENSMUST00000040914 1560 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Rsph6a-202ENSMUST00000076887 1580 ntTSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Nrn1-201ENSMUST00000037623 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Tmem176a-201ENSMUST00000101426 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.02■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Mgme1-203ENSMUST00000110028 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.76
Abca5Q8K448 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Rpl39l-202ENSMUST00000121292 550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Ccnd3-208ENSMUST00000182539 931 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Gatc-201ENSMUST00000139167 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Rassf1-204ENSMUST00000122225 1783 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Erich2-203ENSMUST00000134607 1659 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Zpbp2-203ENSMUST00000107509 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Rhbdf1-201ENSMUST00000020524 2946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Ispd-207ENSMUST00000223205 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Rassf1-202ENSMUST00000093786 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 4930528D03Rik-201ENSMUST00000181528 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Abca5Q8K448 Cnn2-202ENSMUST00000105374 926 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.9 ms