Protein–RNA interactions for Protein: Q8K406

Lgi3, Leucine-rich repeat LGI family member 3, mousemouse

Predictions only

Length 548 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgi3Q8K406 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Plcl2-201ENSMUST00000043938 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Hnrnpu-201ENSMUST00000037748 7640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Cdc25a-201ENSMUST00000094324 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Adgra3-201ENSMUST00000030971 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Gm27275-201ENSMUST00000184318 272 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
Lgi3Q8K406 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Gm1043-204ENSMUST00000207866 4296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Polr2c-201ENSMUST00000109521 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.63□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Cacna1h-202ENSMUST00000159048 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Lgi3Q8K406 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.62□□□□□ -0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.2 ms