Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3N7

Vmn1r72, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 306 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r72Q8K3N7 2210016F16Rik-201ENSMUST00000022032 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Actr8-201ENSMUST00000016115 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Mier2-203ENSMUST00000165028 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Nepro-201ENSMUST00000048788 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Adra2c-201ENSMUST00000049545 3445 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Ubap1-202ENSMUST00000108060 2514 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Dvl2-207ENSMUST00000190940 5037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Zbtb2-201ENSMUST00000100077 3086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Chtop-207ENSMUST00000107346 1321 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Fgfr1-214ENSMUST00000178276 4741 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Enah-202ENSMUST00000111024 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Bcr-201ENSMUST00000164107 6839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Vangl2-203ENSMUST00000111264 2349 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 Stard7-202ENSMUST00000110375 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Vmn1r72Q8K3N7 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 AC140264.2-202ENSMUST00000218746 817 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm17509-201ENSMUST00000165680 2375 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Scin-201ENSMUST00000002640 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tcp1-209ENSMUST00000151287 2446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Lrriq3-201ENSMUST00000029833 2652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Qprt-201ENSMUST00000032912 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Vmn1r72Q8K3N7 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.1 ms