Protein–RNA interactions for Protein: Q8K3I4

Myrip, Rab effector MyRIP, mousemouse

Predictions only

Length 856 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MyripQ8K3I4 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
MyripQ8K3I4 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm43548-201ENSMUST00000197139 2353 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Srpx-202ENSMUST00000115543 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 4930401G09Rik-201ENSMUST00000139500 637 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Prss12-201ENSMUST00000029603 2602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 1700018L02Rik-201ENSMUST00000187897 2485 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gpr6-201ENSMUST00000061796 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Rbm11-202ENSMUST00000114249 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Tsnax-202ENSMUST00000212603 2169 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Gm10489-201ENSMUST00000180511 1466 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
MyripQ8K3I4 Blvrb-204ENSMUST00000133750 509 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms