Protein–RNA interactions for Protein: Q8K330

Ssh3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 649 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssh3Q8K330 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mllt10-204ENSMUST00000114680 3543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Tmem132c-201ENSMUST00000119026 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm42545-201ENSMUST00000202755 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Slc5a10-203ENSMUST00000148584 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm37166-201ENSMUST00000195473 2474 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Dock3-201ENSMUST00000044532 9063 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ttc13-202ENSMUST00000117624 3096 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Tapt1-201ENSMUST00000055128 3513 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Coro2a-202ENSMUST00000107756 4154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Ssh3Q8K330 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Acot7-203ENSMUST00000105652 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Dkk1-201ENSMUST00000025803 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Zscan29-203ENSMUST00000146243 2894 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Ssh3Q8K330 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms