Protein–RNA interactions for Protein: Q8K305

Nsl1, Kinetochore-associated protein NSL1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nsl1Q8K305 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm29458-201ENSMUST00000187093 354 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Rnf208-201ENSMUST00000060818 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Rabep1-201ENSMUST00000076270 5408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Mxd4-201ENSMUST00000042701 3872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Smn1-201ENSMUST00000022147 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Ttc32-201ENSMUST00000085741 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Plcl1-201ENSMUST00000042986 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Itga6-201ENSMUST00000028522 4310 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Hspe1-201ENSMUST00000075242 774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Dhcr24-201ENSMUST00000047973 4028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Txndc11-201ENSMUST00000038424 3095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Adamtsl5-202ENSMUST00000105352 989 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Tspan2os-201ENSMUST00000146624 590 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Rimbp3-201ENSMUST00000169803 5787 ntAPPRIS P1 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Nsmf-207ENSMUST00000116574 2863 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Gm45890-202ENSMUST00000212188 1052 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Klk9-201ENSMUST00000005891 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Nsl1Q8K305 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms