Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2Z4

Ncapd2, Condensin complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,392 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ncapd2Q8K2Z4 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 AC153556.1-201ENSMUST00000215135 794 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Cd300c-201ENSMUST00000061637 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Cd300c-202ENSMUST00000092466 700 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Ap1s1-201ENSMUST00000111080 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm11452-201ENSMUST00000122376 690 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Rhoc-201ENSMUST00000002303 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Dohh-202ENSMUST00000121047 946 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 AC161829.1-201ENSMUST00000220298 281 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Fzd2-201ENSMUST00000057893 3663 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Nr4a1-201ENSMUST00000023779 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Ank1-201ENSMUST00000033947 1030 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Gm2651-201ENSMUST00000203560 838 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Ncapd2Q8K2Z4 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Pcbp4-201ENSMUST00000024260 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Fhdc1-205ENSMUST00000194027 1648 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Trappc6a-202ENSMUST00000108455 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Ciao1-204ENSMUST00000174030 1109 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Gm18421-201ENSMUST00000204122 625 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Dixdc1-207ENSMUST00000121634 2420 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Ncapd2Q8K2Z4 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.5 ms