Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2I9

Fbxo18, F-box DNA helicase 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,042 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fbxo18Q8K2I9 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Rrp15-201ENSMUST00000001339 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
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Fbxo18Q8K2I9 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Smad1-202ENSMUST00000066091 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Cib1-207ENSMUST00000206084 772 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Cib1-202ENSMUST00000071457 702 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Fbxo18Q8K2I9 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Fbxo18Q8K2I9 Sct-202ENSMUST00000167790 507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Fbxo18Q8K2I9 Sct-201ENSMUST00000046156 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Fbxo18Q8K2I9 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 C130026I21Rik-201ENSMUST00000064341 1561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Fbxo18Q8K2I9 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
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Fbxo18Q8K2I9 Tbc1d9-202ENSMUST00000093393 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Fbxo18Q8K2I9 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
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Fbxo18Q8K2I9 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Trim14-201ENSMUST00000046897 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Rbpms2-201ENSMUST00000055844 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Cmtm7-201ENSMUST00000035009 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Acbd3-201ENSMUST00000027780 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Fbxo18Q8K2I9 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms