Protein–RNA interactions for Protein: Q8K2F0

Brd3, Bromodomain-containing protein 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 726 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Brd3Q8K2F0 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Nhsl1-209ENSMUST00000207038 4854 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Brd3Q8K2F0 Ncoa1-201ENSMUST00000085814 7329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Gm2399-201ENSMUST00000104944 225 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Tcf7l1-202ENSMUST00000114053 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Rpl18-202ENSMUST00000209287 1027 ntTSL 3 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Gm45472-201ENSMUST00000211295 1426 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Sgsm2-202ENSMUST00000081799 4873 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 D17Wsu92e-203ENSMUST00000114863 3828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Glis1-201ENSMUST00000046005 2906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Dnajc19-204ENSMUST00000120805 551 ntTSL 2 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
Brd3Q8K2F0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms