Protein–RNA interactions for Protein: Q8K285

Fcho1, F-BAR domain only protein 1, mousemouse

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fcho1Q8K285 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Fcho1Q8K285 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Arhgef33-211ENSMUST00000225658 473 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Kdm5b-203ENSMUST00000112198 5413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Plekhf1-201ENSMUST00000098513 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
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Fcho1Q8K285 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gm26803-201ENSMUST00000181705 2011 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Esyt2-205ENSMUST00000220816 4287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Fcho1Q8K285 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 75.1 ms