Protein–RNA interactions for Protein: Q8K284

Gtf3c1, General transcription factor 3C polypeptide 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c1Q8K284 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm13830-205ENSMUST00000201195 1155 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 AW047730-202ENSMUST00000181406 2579 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gck-202ENSMUST00000109822 1786 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Pex14-201ENSMUST00000103217 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Il4i1-201ENSMUST00000033015 2048 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Clint1-202ENSMUST00000109261 3365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Tpt1-205ENSMUST00000142061 996 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Hint3-203ENSMUST00000161074 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Isg15-201ENSMUST00000085425 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm5464-201ENSMUST00000100453 2156 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Lrrc26-201ENSMUST00000028337 1190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
Gtf3c1Q8K284 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Yipf3-201ENSMUST00000095263 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Ero1lb-203ENSMUST00000221560 1964 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tnk1-202ENSMUST00000108626 1798 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm1818-201ENSMUST00000169406 1184 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm5617-201ENSMUST00000048824 531 ntAPPRIS P1 BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Enoph1-201ENSMUST00000031268 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gfra1-208ENSMUST00000152507 1937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Nr1h3-202ENSMUST00000111354 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Creg1-202ENSMUST00000111432 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm12216-201ENSMUST00000117316 1152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Tdrkh-208ENSMUST00000200486 1231 ntTSL 3 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Dupd1-201ENSMUST00000073870 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm10518-201ENSMUST00000097454 1301 ntAPPRIS P1 BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.32■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Cops6-201ENSMUST00000019638 1787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Golga5-202ENSMUST00000179218 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
Gtf3c1Q8K284 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms