Protein–RNA interactions for Protein: Q8K1E6

Alkbh3, Alpha-ketoglutarate-dependent dioxygenase alkB homolog 3, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Alkbh3Q8K1E6 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Mir5122-201ENSMUST00000175004 89 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Alkbh3Q8K1E6 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Pex6-201ENSMUST00000002840 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Rbpms-201ENSMUST00000033994 2375 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Prss21-201ENSMUST00000024928 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Dlk2-202ENSMUST00000166280 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Alkbh3Q8K1E6 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms