Protein–RNA interactions for Protein: Q8K158

Cnppd1, Protein CNPPD1, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cnppd1Q8K158 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Zfp428-203ENSMUST00000177205 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Zfx-204ENSMUST00000113927 6933 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm16754-201ENSMUST00000181222 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Tmem87b-201ENSMUST00000110325 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Runx2-203ENSMUST00000113572 6463 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm27029-202ENSMUST00000107259 1855 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Gm16201-202ENSMUST00000139218 2330 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Paqr7-201ENSMUST00000081525 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Cnppd1Q8K158 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Mmp11-201ENSMUST00000000924 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Jade2-202ENSMUST00000109090 6230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Gm26885-201ENSMUST00000181920 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 1190002N15Rik-201ENSMUST00000113028 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Zdhhc18-201ENSMUST00000084238 4580 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Cnppd1Q8K158 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.3 ms