Protein–RNA interactions for Protein: Q8JZL7

Rasgef1b, Ras-GEF domain-containing family member 1B, mousemouse

Predictions only

Length 473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Espn-202ENSMUST00000049305 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Rasgef1bQ8JZL7 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef11-201ENSMUST00000039476 6776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 D330020A13Rik-201ENSMUST00000181956 1069 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tekt1-203ENSMUST00000108503 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Bend4-201ENSMUST00000169190 7935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Zfx-201ENSMUST00000088102 7002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Zpbp2-205ENSMUST00000107513 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Pomc-204ENSMUST00000219543 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Adcy7-203ENSMUST00000169037 5198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Camk2n1-201ENSMUST00000050918 4444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Apbb1-214ENSMUST00000189378 2878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Rcbtb2-217ENSMUST00000167401 868 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Rasgef1bQ8JZL7 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.5 ms