Protein–RNA interactions for Protein: Q8CJ53

Trip10, Cdc42-interacting protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 603 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trip10Q8CJ53 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.6■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 6530437J22Rik-201ENSMUST00000207515 773 ntTSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
Trip10Q8CJ53 Matk-201ENSMUST00000105328 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Gm42738-201ENSMUST00000201813 439 ntTSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Fbxo42-201ENSMUST00000030757 5934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Zic1-201ENSMUST00000034927 5606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Gm38027-201ENSMUST00000192315 235 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Olfr1411-201ENSMUST00000073748 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Whrn-207ENSMUST00000107393 4028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Whrn-203ENSMUST00000084510 4049 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Dnajb9-201ENSMUST00000015049 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Trip10Q8CJ53 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms