Protein–RNA interactions for Protein: Q8CIX8

Lgsn, Lengsin, mousemouse

Predictions only

Length 563 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LgsnQ8CIX8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Abhd11-206ENSMUST00000154469 1473 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Col15a1-202ENSMUST00000102917 5172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Mtch2-205ENSMUST00000136872 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 0610012G03Rik-201ENSMUST00000202722 1445 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Jmy-201ENSMUST00000065537 8776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Lcorl-202ENSMUST00000045586 5708 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Cpd-201ENSMUST00000021201 7946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Tmem80-202ENSMUST00000126510 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 1700025A08Rik-201ENSMUST00000200753 609 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Ppm1d-201ENSMUST00000020835 2899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gclm-201ENSMUST00000029769 5589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Alg5-201ENSMUST00000044567 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Mex3a-201ENSMUST00000172699 5778 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Lrrc45-201ENSMUST00000026139 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Irak1-201ENSMUST00000033769 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Ctsh-201ENSMUST00000034915 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Chmp2a-203ENSMUST00000210587 930 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Camsap2-201ENSMUST00000048309 7823 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
LgsnQ8CIX8 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms