Protein–RNA interactions for Protein: Q8CI04

Cog3, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 820 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog3Q8CI04 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 4930448E22Rik-201ENSMUST00000181712 1581 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Stam2-202ENSMUST00000127316 1928 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Acvr1c-204ENSMUST00000112608 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Gm7854-202ENSMUST00000187409 1433 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Cog3Q8CI04 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Eif4g3-202ENSMUST00000084214 6139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Diaph1-205ENSMUST00000115634 5666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Pkp4-202ENSMUST00000102754 4614 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Nfib-206ENSMUST00000107248 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Lsm1-203ENSMUST00000211168 343 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Snx12-201ENSMUST00000077876 1002 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Cog3Q8CI04 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 69.6 ms